Het overzetten van applicaties van een NT-cluster naar een NT-cluster van een andere fabrikant kan problemen opleveren. De applicatie hoeft niet compatibel te zijn; gebruikers moeten dan ook oppassen niet ingesloten te worden in de oplossing van één fabrikant.
Dit stelt adviesbureau Meta Group in één van zijn publikaties. Het probleem zit volgens dit bureau in de programmatuur, die de gang van zaken regelt bij falen van één van de componenten in een cluster. "Dezefailover scripts worden voor ieder platform afzonderlijk geschreven en draaien meestal niet op concurrerende machines", aldus Meta. De meeste scripts zouden niet voldoen aan de standaarden die Microsoft vastgelegd heeft in ‘Wolfpack’- een reeks normen die de server-software van Microsoft tot universeel platform moeten maken.